Vrijstelling voor onderdelen van het programma worden alleen verleend op basis van behaalde certificaten. Dit is een voordeel van onafhankelijke examinering: elders behaalde certificaten hebben bij E3 dezelfde waarde. Vrijstellingsverzoeken worden voorgelegd aan de examencommissie. Tijdens het intakegesprek komt dit verzoek vanzelf aan de orde.
